南京中医药大学创建于1954年，是国家“双一流”建设高校、江苏高水平大学高峰计划A类建设高校，教育部、江苏省人民政府与国家中医药管理局共建高校。学校是全国建校最早的高等中医药院校之一，为新中国高等中医药教育培养输送了第一批师资、编撰了第一套教材、制订了第一版教学大纲，为新中国高等中医药教育模式的确立和推广作出了开创性贡献，被誉为“高等中医教育的摇篮”。
学校拥有仙林、汉中门、泰州三个校区。设有11个学院及第一、二、三临床医学院、鼓楼临床医学院等教学机构，拥有15个附属医院和3个附属药企。学校现有在校生22154名，教职工2056名。
学校坚持以中医药为主体，中西医结合，多学科为支撑协调发展，秉承“学贯中西，至精至诚”的办学理念，坚持传承精华、守正创新。学校现有国家“双一流”建设学科1个，江苏高校优势学科4个，“十四五”省重点学科8个，国家中医药管理局高水平中医药重点学科13个。学校是全国首批博士学位、硕士学位授予单位，有5个一级学科博士学位授权点、1个博士专业学位授权点、12个一级学科硕士学位授权点及9个硕士专业学位授权点，4个博士后科研流动站。教育部第五轮学科评估取得优异成绩，中医学、中药学等主干学科位居全国前列。药理学与毒理学、临床医学、化学、生物学与生物化学、神经科学与行为学、分子生物学与遗传学、农业科学等7个学科进入ESI全球排名前1%，其中，药理学与毒理学学科进入ESI前1‰。学校ESI学科综合排名、软科世界大学学术排名、自然指数排名、U.S.News全球最佳院校排名等世界大学排名均居于全国中医药院校领先地位。
学校不断深化教育教学改革，着力培养德才兼备的一流人才。现有本科专业38个，涉及医、管、理、工、经、文6个学科门类。其中，国家一流本科专业建设点10个，省级一流专业建设点19个，江苏省品牌专业11个。学校与中科院上海药物所、中国中医科学院、康缘药业等知名院所企业合作，联合培养卓越医生（中医学本博连读拔尖创新人才、中医学“5+3”一体化拔尖创新人才、中西医临床医学本博贯通培养拔尖创新人才）、卓越科学家和卓越工程师（中药学本博贯通联合培养拔尖创新人才“屠呦呦班”和“新中药学院班”）。